第二是齐党。其实在方从哲担任首辅以前，其门人，担任给事中的亓诗教就已经组织了齐党。由于亓资历较浅，为了能够达成扩张势力，就力推从哲出山。
齐党的人也不少，包括吏部侍郎赵焕、礼科给事中周永春、右佥都御史韩浚等等。
第三是楚党，包括吏部尚书郑继之、给事中湖广人官应震、吴亮嗣、黄彦士，还有被罢官的熊廷弼。
第四是昆党，以江苏昆山人士、太常寺少卿顾天峻为首。
第五是宣党，以安徽宣州人士、国子监司业汤宾尹为首。
这五个党后来组成了新的党派，又有了统一称谓——“阉党”
值得一题的是还有第六个党派——秦党，均为陕西人。以太仆寺少卿武之望为首，包括兵部侍郎袁应泰、太常寺卿王绍徽等人。秦党首领武之望，性情随和，还是一个医学家，著有《济阴纲目》和《济阳纲目》，外号儒医。
原本秦党创始人为前任吏部尚书孙丕扬，就是前几次京察的主持人之一，数次推荐、提拔了东林党人，有人也把孙丕扬列为东林党。
由于某皇孙的出现加搅合，万里四十五年京察，远比历史上的更加猛烈。
东林党挺不住压力，竟有东林党人出昏招，未经东林党商议便私自上书，称原吏部尚书孙丕扬导致党争不断，将责任通通推向孙丕扬。
此时的孙丕扬已经八十有三，正在老家陕西富平县养老。听闻被东林党泼了脏水，口喊“东林奸佞、误国殃民”，竟气得一命呜呼，直接导致秦党向反东林联盟投诚。
这六大党派在实力近似妖孽的东林党面前，众志成城、团结一致，开展了不屈不挠的斗争，终于在万历四十五年取得了辉煌的战绩。
万历四十五年京察，组织者：吏部尚书郑继之——楚党；刑部尚书李志——浙党。
满朝文官受尽了东林党人的折磨，纷纷开始报仇。
首先开炮的是户部主事李朴，上疏曰：“言官多勾结贵戚、近侍，广纳赂遗，结党逞威，挟制百僚，排斥正人”所指当然是东林党人，
于是首辅方从哲，迎合帝意，无所匡正，对朝中奸佞实施毁灭性的打击。
就连一些从来没参加过党争的官员也来踩上一脚，朝堂上东林党在京官员纷纷落马，除了杨涟、孙承宗等少数官员外，一时间东林党人几乎一扫而空。
一些平时和东林党关系较近的官员，纷纷划清界限，声称与东林党势不两立！秦党就是典型代表。
东林党人也不是没有进行反击，可是效果甚微。原本鉴于辽东经略缺人，有大臣推荐，启用李三才为辽东经略。于是原本应该在家钓鱼、现任南直隶礼部尚书的东林党人李三才，被满朝官员集体弹劾，最终只能从南直隶卸任，回家数银子去了。
万历四十五年京察过后，共选派主事等二百六十五名京官，其中东林党无人入选；共选派知州等一百五十名外地官员，亦无东林党人入选。
东林党也不是省油的灯，京察失败，地方还在。地方任职的官员用怠政的方式抗争。作为大商人代表的东林党，开始用各种方式抵制税监，不少地方组织农民对抗朝廷收税，让赋税收取十分困难，让大明朝本就紧张的财政雪上加霜。
面对辽东局势危急，方从哲建议请发军饷一百万两，也因为东林党人的暗中作梗，户部拿不出钱。方从哲又数次面圣，请求万历拿出内帑，也被数次否决。
还好，此时的官员们还算敬业，搞定了东林党，纷纷开始干自己的本职工作，不少官职的空缺也被补齐，朝政也开始正常运转。
不过也有和皇三孙子朱由楫有点关联的事，原本空缺的尚宝司卿，由嘉定人、工科给事中归子顾接任。另外，万历皇帝还赏赐皇三孙子两千三百两银子，数量正好和皇三孙子贪墨的耕地相同。
空缺职位中，最引人瞩目的就是辽东经略。
至于辽东经略的人选倒是有几个。
按照惯例，辽东经略由首府推荐，原本方从哲是想推荐浙党人、兵部侍郎杨镐，这杨镐虽然在朝鲜战场表现“略差”，可是资历高、善于搞关系，更是浙党冲锋陷阵的干将。
方从哲暗暗惋惜：“如果能杨镐经略辽东，必能驱除建奴！”
只可惜受女真细作事件牵连，杨镐已经发配到琼州吃香蕉去了，杨镐在京师的产业也被某些无良皇孙侵占。
方从哲无奈，心中想推荐姚宗文。这姚宗文也算是“熟知”军务，只是他为万历三十五年进士，经略辽东的话资历太浅。
另外最适合的就是兵部侍郎袁应泰了，袁应泰本属秦党，和东林党关系密切，不过秦党在万历四十五年京察中，主动投诚，投入到浙党怀抱。
能在大明当七年独相的方从哲，也是和稀泥高手，既然人选定不下来就集思广益。
于是在万历四十五年十二月初一，在京师群英楼，宴请浙、齐、楚、昆、宣、秦六大党派高层，一是庆祝击败东林恶魔；二是让大家推选辽东经略。